Ce que nous publions ici n’est pas une version sine varietur des notes de Pierre Ruelle. Pour toutes les transcriptions des textes, nous avons effectué une lecture de contrôle sur les reproductions des manuscrits, xylographes et incunables, qui nous ont amenés occasionnellement à corriger ou compléter le texte édité par Pierre Ruelle.

Nous n’avons pas copié certains ajouts manuscrits dans les marges des feuillets dactylographiés, notamment ceux qui permettaient à Pierre Ruelle de marquer les termes qu’il envisageait de reprendre dans les tables et index et qui ne sont utiles que dans la perspective d’une étude « génétique » du travail du philologue.

En revanche, nous avons maintenu systématiquement les traits | introduits à la main dans le texte dactylographié et les avons fait suivre immédiatement du numéro également manuscrit que Pierre Ruelle reportait dans la marge en regard de chacun de ces traits, sans nous soucier de la cohérence de ces traits et de leur numérotation.